下面介绍一下尼尔机械纪元的故事剧情，对于本作剧情背景设定不了解的玩家，不妨看看。
尼尔机械纪元故事背景简介：
- 游戏故事发生在初代之后，外星生命入侵地球。
- 外星生命开发出了机械生命体作为武器(游戏中各种圆脑袋)。
- 人类由于完全干不过这些机械生命体，只好逃亡月球。
- 剩余在地球上的人形机器人组成了抵抗组织与机械生命体进行战斗。
- 人类也成立了专门的战斗用部队“欧罗哈”，2B，9S等也是其中成员。2B是战斗型机器人，9S是侦查型机器人。
- 游戏本篇的内容就发生在2B和9S前往地球执行任务的过程，同时也发现了事件背后的真相。
